O presente trabalho tem como objetivo propor índices subnacionais de C,T&I, fazendo uma aplicação aos estados brasileiros. O estudo está baseado em variáveis relevantes indicadas pela literatura. A partir dessas variáveis, utilizou-se uma metodologia de cálculo inspirada no IDH. O estudo avança em relação aos demais, em função da adaptação metodológica e das variáveis utilizadas, propondo a construção a partir de bases disponíveis, de forma a não haver descontinuidades nas séries. Os resultados confirmam que há disparidades entre os entes federados, com alto grau de concentração nos estados do Sudeste, principalmente São Paulo. Isso confirma a existência de desigualdades estaduais e regionais. Estados do Norte e Nordeste estão, em sua maioria, na pior classificação, demonstrando uma certa fragilidade dos sistemas locais de inovação brasileiros.